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Monarch?高分子量DNA提取試劑盒(組織)貨號(hào)#T3060LNEB酶試劑NewEnglandBiolabs

2023-09-24

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產(chǎn)品資料 – 核酸純化 – 基因組DNA提取Monarch? 高分子量 DNA 提取試劑盒(組織) 收藏

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#T3060L50 preps5,399.00 有無(wú)無(wú)無(wú)無(wú)

#T3060S5 preps899.00 有無(wú)無(wú)無(wú)無(wú)

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特性

· 用于從組織、細(xì)菌和其它樣品(酵母、昆蟲(chóng)、兩棲動(dòng)物)中提取高分子量 DNA

· 從軟組織和細(xì)菌中提取純化的 DNA 片段大小達(dá)到 Mb 范圍

· 對(duì)于一些樣品,通過(guò)改變裂解過(guò)程中的離心速度,調(diào)節(jié)提取 DNA 的片段大小

· 操作流程簡(jiǎn)單、便捷(組織和細(xì)菌樣品 90 分鐘)

· 獲得的 DNA 產(chǎn)量、純度和完整性極佳

· 快速、高效的洗脫

· 是長(zhǎng)片段測(cè)序的理想選擇

· 包含 RNase A 和蛋白酶 K,以及微管研棒便于樣品勻漿

產(chǎn)品說(shuō)明

Monarch® 高分子量 DNA 提取試劑盒(組織)為從組織、細(xì)菌及其它樣品(包含酵母、昆蟲(chóng)和兩棲動(dòng)物)中提取完整的高分子量(HMW)gDNA 提供了快速的操作流程。針對(duì)于組織的提取方案為:首先使用研棒勻漿和蛋白酶 K 攪拌裂解樣品,然后進(jìn)行蛋白質(zhì)去除,并將提取的 DNA 附著到大玻璃珠的表面。如果提取樣品為細(xì)菌,則需要在蛋白酶 K 消化之前,使用溶菌酶對(duì)細(xì)菌細(xì)胞壁進(jìn)行充分裂解。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)流程提取的 DNA 在 50-250 kb 之間,如果將離心速度降到最低,提取的 DNA 片段可達(dá) Mb 范圍。純化后的 DNA 產(chǎn)量和純度極高,且?guī)缀跬耆缓?RNA。組織和細(xì)菌樣品提取時(shí)間為 90 分鐘。組織和細(xì)菌 A260 / A280 檢測(cè)純度為 1.8-1.9,組織 260/230 檢測(cè)純度為 2.1-2.5,細(xì)菌 260/230 檢測(cè)純度為 2.1-2.2。純化后的 HMW DNA 適用于多種下游應(yīng)用,包括長(zhǎng)片段測(cè)序(Oxford NanoporeTechnologies®和 PacificBiosciences®),光學(xué)圖譜(BionanoGenomics®)和 Linked-Reads 基因組組裝。

圖 1:使用 Monarch 高分子量 DNA 提取試劑盒從組織中提取純化 HMW DNA 的操作流程

圖 2:Monarch 高分子量 DNA 提取試劑盒(組織)可從多種樣品中高效提取純化高質(zhì)量的 HMW DNA

使用 Monarch 高分子量 DNA 提取試劑盒(組織)提取 HMW 基因組 DNA。提取樣品為:凍存大鼠腎臟 10 mg、新鮮小鼠肝臟 10 mg、凍存小鼠大腦 20 mg、新鮮小鼠肌肉 20 mg、凍存大腸桿菌 2 x 109、蠟樣芽孢桿菌 2 x 108、新鮮非洲爪蟾 4 mg、新鮮釀酒酵母 3.8 x 108 和凍存埃及埃及斑蚊 15 mg。參照試劑盒說(shuō)明書(shū)操作,離心速度為 2000 rpm。釀酒酵母使用經(jīng)調(diào)整的操作流程。從平行實(shí)驗(yàn)樣本中分別取 500 ng DNA 產(chǎn)物通過(guò) PFGE 分離(在 BioRad® CHEF-DR® III 系統(tǒng)上,使用 1% 瓊脂糖凝膠,6 V / cm,13℃ 電泳 20 小時(shí),切換時(shí)間為 0.5-94 秒)。各樣品的產(chǎn)量和純度見(jiàn)下表標(biāo)注。分子量標(biāo)準(zhǔn)為 Lambda PFG Ladder(NEB#N0341)。

圖 3:在從組織和細(xì)菌中提取 HMW 基因組 DNA 的裂解過(guò)程中,使用不同的離心速度可調(diào)節(jié)提取片段長(zhǎng)度

使用 Monarch 高分子量 DNA 提取試劑盒(組織)提取純化 HMW 基因組,測(cè)試樣品為小鼠腎臟(10 mg,圖 3A)和大腸桿菌 NEB10 beta(1 x 109 細(xì)胞,圖 3B)。在裂解步驟中,按照?qǐng)D中標(biāo)注的速度離心樣品,以控制 DNA 的片段化。從平行實(shí)驗(yàn)樣本中取等量的 DNA 產(chǎn)物(小鼠腎臟:300 ng;大腸桿菌:500 ng)通過(guò) PFGE 分離(在 BioRad® CHEF-DR® III 系統(tǒng)上,使用 1% 瓊脂糖凝膠,6 V / cm,13℃ 電泳 20 小時(shí),切換時(shí)間為 0.5-94 秒)。分子量標(biāo)準(zhǔn)為 Lambda PFG Ladder(NEB#N0341)。各樣品的產(chǎn)量、純度和 DIN 值見(jiàn)下表標(biāo)注。

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