品牌: biomedworld 公司: 沃登醫學

提供商： 沃登醫學 服務名稱： 轉錄組de novo測序

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一、服務介紹轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有mRNA的總和。轉錄組研究是基因功能及基因結構等研究的基礎，通過新一代高通量測序，能夠全面快速的獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息，已廣泛應用于臨床診斷、基礎研究和藥物研發等領域。轉錄組De novo測序也稱為轉錄組從頭測序，不需要任何參考轉錄組序列資料，即可對某物種特定組織或細胞的轉錄本進行測序，用生物信息學分析方法進行拼接和組裝，從而獲得該物種相關的轉錄本信息。本公司轉錄組De novo測序技術具有以下特點:1.覆蓋度高：直接測定幾乎所有轉錄本片段序列；2.分辨率高：可以檢測基因家族中相似基因及可變剪接造成的單堿基及序列差異；3.鑒定范圍廣：可同時鑒定表達正常和稀有的轉錄本；4.任意物種的全轉錄組分析：無需設計特異性探針，無需任何參考序列信息，直接進行最全面的轉錄組分析。二、服務內容1.服務流程2.標準信息分析1）.對原始數據進行去除接頭序列及低質量reads的處理2）.數據產出統計及測序數據的成分和質量評估3）.組裝結果分析（Contig長度分布、Unigene長度分布）4）.Unigene功能注釋及COG分類5）.Unigene的GO分類6）.Unigene代謝通路分析7）.預測編碼蛋白框（CDS）8）.Unigene表達差異分析（兩個或兩個以上樣品）9）.Unigene在樣品間的差異GO分類（需兩個或兩個以上樣品）和Pathway富集性分析10）.SNP分析11）.SSR開發及引物設計3.個性化信息分析（≥ 5個樣品）1）.條件特異表達分析（適用于真核生物）2）.主成分分析三、服務說明：1.樣品類型：細胞、新鮮組織或RNA樣品；2.樣品需求量：細胞樣品≥1×107個，動物組織≥1 g，植物組織≥2 g，總RNA≥10 μg；3.樣品濃度：RNA樣品≥100 ng/μL；4.樣品純度：OD 260/OD280在1.8-2.2之間，OD 260/OD230≥2，28S/18S≥1，動物樣品RIN≥7.0，植物樣品RIN≥6.5，RNA無明顯降解；5.項目運轉周期：標準流程的運轉周期為約40個工作日；6.若另有疑問歡迎向本公司咨詢，我們將竭誠為您服務。四、質量承諾1.準確可靠的轉錄組測序結果；2.專業權威的測序結果分析；3.真實的原始實驗數據；4.詳細的實驗步驟。