品牌: shyijisy
公司: 上海一基實(shí)業(yè)有限公司
貨號: YJ011202 L 供應(yīng)商: 上海一基實(shí)業(yè)有限公司 數(shù)量: 100
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致病微生物系列致瀉大腸埃希氏菌鑒定劑盒(PCR
法)產(chǎn)品說明致瀉大腸埃希氏菌鑒定劑盒參照《GB4789.6—2016 食品安全國家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗(yàn) 致瀉大腸埃希氏菌檢驗(yàn)》進(jìn)行設(shè)計(jì),
可針對食品樣品中的致瀉大腸埃希氏菌特異核酸片段進(jìn)行擴(kuò)增,通過電泳判斷樣品的鑒定結(jié)果。該產(chǎn)品檢出限為10^3 cfu/ml(使用旋達(dá)071021M細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取1 ml 10^3cfu/ml增菌液的細(xì)菌基因組DNA作為模板)。
一管式檢測試劑為本公司研發(fā)的產(chǎn)品,與傳統(tǒng)PCR法檢測試劑具有等效的檢測性能,其中的固封液不影響檢測反應(yīng)與熒光檢測性能,并且對試劑蒸發(fā)與氣溶膠污染起到一定的防范作用。該產(chǎn)品無需分裝試劑,有效減少反復(fù)凍融及分裝過程中造成的試劑活性下降及試劑污染,無需增設(shè)試劑配置區(qū),省時(shí)省力省空間
。(該產(chǎn)品反應(yīng)液中已含熒光染料,可直接使用熒光定量PCR儀進(jìn)行定性檢測)◆
產(chǎn)品組成(96
測試)試劑含量作用孔1反應(yīng)液-uidA23μl/孔12孔/排8排(本產(chǎn)品使用12聯(lián)PCR管分裝,每排含12種反應(yīng)液各23ul)內(nèi)參孔2反應(yīng)液-ipaH鑒定EIEC孔3反應(yīng)液-pic鑒定EAEC孔4反應(yīng)液-aggR鑒定EAEC孔5反應(yīng)液-astA鑒定EAEC孔6反應(yīng)液-stx1鑒定EPEC與EHEC孔7反應(yīng)液-stx2鑒定EPEC與EHEC孔8反應(yīng)液-bfpB鑒定EPEC與EHEC孔9反應(yīng)液-escVa鑒定EPEC與EHEC孔10反應(yīng)液-lt鑒定ETEC孔11反應(yīng)液-stp鑒定ETEC孔12反應(yīng)液-sth鑒定ETECNG-Ecoli100μL × 1支陰性對照NG-DW100μL × 1支空白對照PG-Ecoli100μL × 1支陽性對照Loading Buffer600μL×1支電泳上樣緩沖液
◆
所需儀器ABI
,BioRad
,TaKaRa等PCR
擴(kuò)增儀,電泳儀,凝膠成像儀等電泳配套設(shè)備。(使用熒光定量PCR
儀進(jìn)行定性判讀時(shí)則無需電泳設(shè)備)◆
自備耗材和儀器①
滅菌1.5mL
或2.0mL離心管;②
冰盒;③
移液器(1-10μL
,10-100μL
,100-1000μL
)及配套滅菌吸頭;④
離心機(jī);⑤
渦旋混勻器;⑥
金屬浴。◆
樣品處理參照《GB4789.6—2016
食品安全國家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗(yàn) 致瀉大腸埃希氏菌檢驗(yàn)》中的操作步驟進(jìn)行前增菌。建議使用試劑配套細(xì)菌基因組DNA
提取系列產(chǎn)品。◆
實(shí)驗(yàn)操作1
.添加模板(樣本制備區(qū),放置于冰盒中進(jìn)行)取所待檢樣品數(shù)+3
的12聯(lián)反應(yīng)管,將試劑完全解凍,分離心30s
。離心后揭開封口膜,使用穿刺加樣法穿過固封層向每管反應(yīng)液中分別加入2μL模板(或直接使用無菌吸頭挑取少許待檢菌落至反應(yīng)管中)。加樣示例:(有2
個(gè)待測樣品)取5
排12聯(lián)反應(yīng)管,按順序第一排全部加NG-DW,第二排全部加NG-Ecoli,第三排全部加樣品1,第四排全部加樣品2,第五排全部加PG-Ecoli。蓋好配套的PCR
管蓋后,渦旋混勻30s,離心1min,立即進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。2.
擴(kuò)增反應(yīng)(擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū))按下列條件設(shè)置擴(kuò)增反應(yīng):(如需使用熒光法進(jìn)行檢測請選擇FAM
通道)PCR循環(huán)熒光收集位點(diǎn)95℃10分鐘1個(gè)循環(huán)—95℃30秒30個(gè)循環(huán)—63℃30秒—72℃90秒※72℃5分鐘1個(gè)循環(huán)—
3.
產(chǎn)物電泳(擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū))稱量4. 0g
瓊脂糖粉,加入至200 mL的1×TAE電泳緩沖液中,充分混勻。使用微波爐反復(fù)加熱至沸騰,直到瓊脂糖粉完全融化形成清亮透明的溶液。待瓊脂糖溶液冷卻至60℃
左右時(shí),加入溴化乙錠( EB )
至終濃度為0.5μg/mL,充分混勻后,輕輕倒入已放置好梳子的模具中,凝膠長度要大于10cm
,厚度宜為3mm~5mm
。檢查梳齒下或梳齒間有無氣泡,用一次性吸頭小心排掉瓊脂糖凝膠中的氣泡。當(dāng)瓊脂糖凝膠完全凝結(jié)硬化后,
輕輕拔出梳子,小心將膠塊和膠床放入電泳槽中,樣品孔放置在陰極端。向電泳槽中加入1×TAE
電泳緩沖液,液面高于膠面1mm~2mm
。將 5μLPCR
產(chǎn)物與1μL6×
上樣緩沖液混勻后,用微量移液器吸取混合液垂直伸入液面下膠孔,小心上樣于孔中;陽性對照的 PCR
反應(yīng)產(chǎn)物加入到最后一個(gè)泳道;第一個(gè)泳道中加入 2 μ L 分子量 Marker 。接通電泳儀電源,根據(jù)公式:電壓=
電泳槽正負(fù)極間的距離(cm
)×5V/cm
計(jì)算并設(shè)定電泳儀電壓數(shù)值;啟動電壓開關(guān),電泳開始以正負(fù)極鉑金絲出現(xiàn)氣泡為準(zhǔn)。電泳30min~45min
后,切斷電源。取出凝膠放入凝膠成像儀中觀察結(jié)果,拍照并記錄數(shù)據(jù)。可使用Gold view、Gal-Rad等等效的核酸熒光染料替代EB。推薦使用DNA Marker:DL2000或100bp ladder,等可指示100bp~1500bp條帶的Marker。
結(jié)果分析陰陽性判讀:
進(jìn)行電泳檢測時(shí),需對比Marker
進(jìn)行判斷,當(dāng)目的靶標(biāo)對應(yīng)位置出現(xiàn)單一顯著條帶時(shí)可判斷該靶標(biāo)為陽性;否則為該靶標(biāo)檢測為陰性。(使用熒光定量PCR儀檢測時(shí),檢測孔Ct≤30時(shí)判斷該孔為陽性;當(dāng)檢測孔Ct
>30時(shí),該檢測孔為陰性)示例電泳圖有效性判讀:
需同時(shí)滿足:1.空白對照中所有泳道均為陰性;2.陰性對照中uidA
泳道陽性,其余泳道陰性;2.陽性對照中所有泳道陽性,此時(shí)可判斷實(shí)驗(yàn)有效。如無法滿足上述條件,則實(shí)驗(yàn)無效,需重復(fù)實(shí)驗(yàn);如重復(fù)后結(jié)果仍為無效,請于本公司技術(shù)支持聯(lián)系。
結(jié)果判讀:
在實(shí)驗(yàn)有效的情況下,可根據(jù)下表進(jìn)行判讀:致瀉大腸埃希氏菌類別目標(biāo)條帶的種類組合EIECipaH(+)uidA(+/-)EAECaggR,astA,pic中一條或一條以上陽性EPECbfpB(+/-),eae(+),stx1(-)stx2,(-)STEC/EHECstx1,stx2中一條或一條以上陽性,eae(+/-),bfpB(-)ETEClt,stp,sth中一條或以上陽性
97%以上大腸埃希氏菌為uidA陽性,可參考陰性對照中該基因檢測結(jié)果判斷擴(kuò)增效果;當(dāng)結(jié)果判定為EPEC陽性時(shí),若bfpB靶標(biāo)為陽性則說明樣品含有典型EPEC;若bfpB靶標(biāo)為陰性則說明樣品為非典型EPEC;當(dāng)結(jié)果判定為STEC/EHEC陽性時(shí),若eae靶標(biāo)為陽性則說明樣品含有典型EHEC;若eae靶標(biāo)為陰性則說明樣品為非典型EHEC。
◆
注意事項(xiàng)1.本試劑檢測靈敏度高。為了防止污染,實(shí)驗(yàn)要分區(qū)操作。1)第一區(qū):樣本制備區(qū)。2)第二區(qū):擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū)。 ★
分區(qū)之間最好進(jìn)行物理性隔離,避免人為因素造成的污染。2. 實(shí)驗(yàn)過程中穿戴工作服和乳膠手套,使用移液器,試驗(yàn)產(chǎn)生的所有廢棄物及時(shí)處理。3.嚴(yán)格按照操作步驟操作,試劑配制和加樣等步
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